Die Stiftung Brunegg ist eine soziale Institution und betreibt für Menschen mit überwiegend kognitiver Beeinträchtigung ein Wohnheim, eine Gärtnerei, zwei Blumenläden, eine Arbeitsplatzvermittlung in die freie Wirtschaft und ein Atelier. Gemäss Stiftungsurkunde aus dem Jahre 1988 ist der Stiftungszweck "der Betrieb eines Wohnheimes mit Beschäftigung für schulentlassene Menschen mit Behinderung vorwiegend aus dem Kanton Zürich". Dazu sollen alle notwendigen Massnahmen getroffen werden, insbesondere solche, die zur Schulung, Förderung und Eingliederung dienen.
Die Stiftung Brunegg sieht sich als Dienstleister für Menschen mit Unterstützungsbedarf. Sie bietet insgesamt 40 differenzierte Wohn-, 58 geschützte Arbeits- und rund 20 Ausbildungsplätze an. Dazu gehören die Ausbildungs- und Arbeitsplätze in den verschiedenen Gruppen der Gärtnerei, der Hauswirtschaft, der Küche und dem Technischen Dienst sowie 25 Atelierplätze für Menschen mit komplexeren Beeinträchtigungen. Zur kompetenten Lebens- und Alltagsgestaltung werden sportliche Aktivitäten, Weiterbildungskurse und verschiedene Therapien angeboten. Wichtig ist es der Stiftung Brunegg, dass die Menschen, welche die Angebote der Stiftung nutzen, stolz auf ihre Arbeitstätigkeit sind und sich wertgeschätzt erleben. Jeder Mensch soll sich seinen Kompetenzen entsprechend in den Alltag einbringen können.
Die meisten Arbeits- und Ausbildungsplätze befinden sich in der Gärtnerei, in der Stauden und Zierpflanzen produziert werden. In den zwei Blumenläden finden Kunden ein umfassendes Floristikangebot. Vier Gruppen bieten ihre Dienste für Gartengestaltung und Gartenpflege an.
Seit April 2019 betreibt die Stiftung Brunegg immer mittwochs und donnerstags das Bahnhöfli Kafi in Hombrechtikon.
Im Atelier werden 25 Menschen mit komplexen Beeinträchtigungen ihren Bedürfnissen entsprechend individuell begleitet und unterstützt. Im Wohnbereich werden den Fähigkeiten und Bedürfnissen entsprechend 40 Wohnplätze in verschiedenen Wohnformen angeboten. Davon sind 5 Wohnplätze für Jugendliche in Ausbildung reserviert.