Der Orden setzt sich aus Grossprioraten, Prioraten und Kommenden zusammen. Ein Grosspriorat setzt sich zusammen aus mehreren Prioraten. Ein Priorat kann für sich allein bestehen oder sich aus mehreren Kommenden zusammensetzen. Die Kommende ist die kleinste Einheit des Ordens.

Der OSJ besteht derzeit aus 3 Grossprioraten, 17 Prioraten und 29 Kommenden in 17 Ländern.